Причем тут SQL? На скриншоте нет ничего про него.
Гугл говорит, что эта ошибка означает, что произошло что-то странное с файловой системой, что-то повредилось и т.д.
Надо сделать бэкап (посекторный) если там есть что-то важное.
После этого, если проблема не в железе, можно например попробовать xfs_repair.
https://xfs.org/index.php/XFS_FAQ#Q:I_see_applications_returning_error_990_or.22Structure_needs_cleaning.22.2C_what_is_wrong.3F